Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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UBE4AQ14139 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE4AQ14139 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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