Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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COL9A2Q14055 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL9A2Q14055 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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