Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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COL4A6Q14031 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
COL4A6Q14031 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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