Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF2H3Q13889 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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