Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOFQ13790 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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APOFQ13790 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOFQ13790 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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