Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ALCAMQ13740 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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