Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TUBB3Q13509 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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