Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MSLNQ13421 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MSLNQ13421 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms