Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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