Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
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