Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms