Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXD4Q12950 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms