Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRJQ12913 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.3 ms