Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFCP2Q12800 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms