Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNMA1Q12791 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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KCNMA1Q12791 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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KCNMA1Q12791 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNMA1Q12791 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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