Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELP6Q0PNE2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELP6Q0PNE2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms