Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4BQ07343 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms