Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL16A1Q07092 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms