Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms