Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NHLH2Q02577 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms