Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
OC90Q02509 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
OC90Q02509 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
OC90Q02509 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OC90Q02509 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OC90Q02509 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
OC90Q02509 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OC90Q02509 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms