Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFAMQ00059 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms