Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMF1P82094 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMF1P82094 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMF1P82094 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMF1P82094 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMF1P82094 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMF1P82094 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms