Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms