Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ABCE1P61221 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms