Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2NP61088 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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