Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB15P59190 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB15P59190 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB15P59190 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB15P59190 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms