Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RHBDL3P58872 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHBDL3P58872 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms