Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF3P57682 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF3P57682 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF3P57682 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLF3P57682 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms