Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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RAB5CP51148 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB5CP51148 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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