Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIP4K2AP48426 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms