Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GPD2P43304 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GPD2P43304 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPD2P43304 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPD2P43304 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPD2P43304 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPD2P43304 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPD2P43304 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPD2P43304 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPD2P43304 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPD2P43304 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPD2P43304 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GPD2P43304 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GPD2P43304 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms