Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDIT3P35638 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDIT3P35638 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDIT3P35638 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDIT3P35638 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms