Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
OTX2P32243 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTX2P32243 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms