Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC13P31276 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms