Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms