Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALDH4A1P30038 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms