Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSFA2P28290 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms