Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms