Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms