Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE4AP27815 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms