Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NFKBIAP25963 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NFKBIAP25963 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms