Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMA1P25786 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMA1P25786 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms