Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRBP23467 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPRBP23467 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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