Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PTPRAP18433 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PTPRAP18433 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PTPRAP18433 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PTPRAP18433 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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PTPRAP18433 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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