Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms