Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CPEP16870 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPEP16870 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPEP16870 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CPEP16870 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CPEP16870 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CPEP16870 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms