Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VPREB1P12018 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms