Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ODC1P11926 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODC1P11926 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODC1P11926 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODC1P11926 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms