Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NGFRP08138 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NGFRP08138 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NGFRP08138 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NGFRP08138 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms